新疆昌吉衛(wèi)生學校是全國高等衛(wèi)生職業(yè)技術(shù)教育協(xié)作會常務理事單位、全國醫(yī)療衛(wèi)生信息技術(shù)培訓與認證指定培訓基地、新疆中等職業(yè)教育醫(yī)藥衛(wèi)生專業(yè)指導委員會主任單位、新疆中等醫(yī)學教育研究會主任單位、新疆職業(yè)院校思想政治教育研究會副會長單位。是新疆維吾爾自治區(qū)建校最早的衛(wèi)生學校之一。
截至2010年9月，新疆昌吉衛(wèi)生學校占地面積117畝，建筑面積62239.21平方米，校內(nèi)固定資產(chǎn)總值6196萬元，教學儀器設備總值1726.3萬元，擁有校園網(wǎng)、多媒體、閉路電視雙向控制系統(tǒng)、雙衛(wèi)網(wǎng)、VOD視頻點播等先進的教學設備。新疆昌吉衛(wèi)生學校圖書館建筑面積1870平方米，圖書館藏書10萬余冊，電子閱覽室有計算機80臺，電子藏書8萬余冊。新疆昌吉衛(wèi)生學校體育場面積1.7萬平方米，有250米塑膠環(huán)形跑道及籃球場、乒乓球場等，另有1184平方米的室內(nèi)運動場，裝備有現(xiàn)代化的電子體育設施和健身器械。截至2010年9月，新疆昌吉衛(wèi)生學校在校生人數(shù)4100余人。
新疆昌吉衛(wèi)生學校開設有護理、藥劑、口腔工藝技術(shù)等15個專業(yè)，設有護理、藥學、三理、解剖、生物與微生物、臨床等13個教研組，建立了解剖、病理、中草藥等標本室和基礎護理、臨床護理、藥劑、臨床檢驗等45個實驗實訓室。
截至2010年9月，新疆昌吉衛(wèi)生學校為社會培養(yǎng)了2萬余名畢業(yè)生，學校先后榮獲全國十佳辦學單位、中國校園文化建設百佳示范學校、全國教育網(wǎng)絡系統(tǒng)示范單位。《中國教育報》、《人民日報》、《昌吉日報》等媒體多次報道了該校特色辦學情況。
2001年新疆昌吉衛(wèi)生學校被批準為國家級重點中等職業(yè)學校，2002年新疆昌吉衛(wèi)生學校獲得新疆維吾爾自治區(qū)精神文明單位，2003年國家教育部對國家級重點中專復評中，專家組認為新疆昌吉衛(wèi)生學校在全疆中等職業(yè)學校中具有較強的典型示范作用，2004年新疆昌吉衛(wèi)生學校成為國家教育部確定的六十五所“全國護理專業(yè)技能型緊缺人才示范性培訓基地”院校之一。2007年新疆昌吉衛(wèi)生學校在新疆維吾爾自治區(qū)衛(wèi)生職業(yè)學校專業(yè)設置評估中取得最好成績，2008年新疆昌吉衛(wèi)生學校在新疆維吾爾自治區(qū)第一批重點中等職業(yè)學校人才培養(yǎng)水平評估中取得第一名。2008年、2009年連續(xù)兩年新疆昌吉衛(wèi)生學校獲得新疆維吾爾自治區(qū)護理技能大賽團體一等獎，2009年8月10日新疆昌吉衛(wèi)生學校獲得全國職業(yè)院校護理技能操作大賽團體一等獎，2010年新疆昌吉衛(wèi)生學校獲得新疆維吾爾自治區(qū)職業(yè)院校“醫(yī)模杯”護理專業(yè)（中職組）技能大賽團體一等獎。